A Confederação Brasileira de Futebol (CBF) alterou o modelo de disputa para esta temporada. Diferente dos anos anteriores, em 2025, os clubes irão se enfrentar dentro de chave. Dessa forma, cada equipe vai realizar sete partidas na fase de grupos.

Os clubes melhores ranqueados de cada estado ficaram automaticamente em grupos separados. Sendo assim, não se enfrentam na primeira fase: Fortaleza e Ceará, Bahia e Vitória, Sport e Náutico, CRB e CSA, além de Sampaio Corrêa e Moto Clube.

Confiança, Ferroviário, Altos, América-RN, Juazeirense e Sousa-PB ficam livres para serem sorteados em qualquer um dos grupos. O cruzamento entre as equipes do Grupo A com as do Grupo B só acontecerá a partir das quartas de final.